・L’expansion du christianisme s’est arrêtée sur la péninsule de Shimabara avec la rébellion de Shimabara-Amakusa, mais elle a pu ensuite reprendre à partir de 1902.
・En 1932, une nouvelle paroisse a été créée à Isahaya avec la construction de l’église de Shimabara Ninomaru.
・En 1997, 400 ans après la mort des Vingt-six martyrs du Japon, l’église a été renommée église des martyrs de Shimabara.
・À côté de l’église se trouve une statue du prêtre Julião Nakaura, un ancien membre de l’ambassade Tensho qui a visité les chrétiens de Kyushu depuis Kuchinotsu pendant la période d’interdiction du christianisme.