长崎开港的第二年(1571年),耶稣会的葡萄牙传教士菲格雷多在小镇所在的海岬的顶端建立了“岬之教会(圣保罗教会)”。
另外,在增建新教堂的过程中,被秀吉下令拆除,之后又反复扩改建和重建,1601年,建起了长崎最大的“升天圣母教堂(升天的圣玛利亚教堂)”,主教府和神学院等建筑也在同一时间建成,教堂则成了日本主教坐镇的主教座堂。另外,在此之前的1593年,日本耶稣会总部也曾设在这里。
16世纪后期到17世纪初期,长崎建起了多间教堂,作为南蛮贸易的中心地,其繁荣景象被称作“小罗马”。但随着1614年德川幕府颁布禁教令,包括建在海岬的教堂在内的几乎所有教堂都被拆毁,基督风情的街道也消失了。
后来,此地历代都设有重要设施,1633年设立长崎奉行所西役所,1855年设立海军传习所,1857年设立医学传习所,1874年设立长崎县厅(2018年搬迁)。
在原长崎县厅舍旧址,立有“耶稣会总部遗址”、“奉行所西役所”、“海军传习所”三块碑,入口附近还设有介绍这三个设施的向导牌。
※根据原县厅舍旧址埋藏文化遗产调查(计划到2025年度为止)的开展情况,可能会看不到碑。