・Ce musée est construit dans l’enceinte du château de Fukue, qui donne sur la mer sur trois de ses côtés. Le bâtiment est une reproduction du donjon du château. Les vestiges de ce château abritent également d’autres bâtiments culturels, comme un lycée, un centre culturel et une bibliothèque.
・Le musée expose des objets utilisés par les chrétiens cachés ou datant de l’époque de clandestinité du christianisme. Les visiteurs pourront également y admirer les vitraux de l’ancienne église de Gorin et l’orgue de l’église de Zazare.
・D’autres sections du musée présentent des vestiges extraits de sites datant du paléolithique et des époques Jomon et Yayoi. Les îles Goto ne sont pas en reste avec une zone dédiée à la nature, aux coutumes et aux fêtes de cette région, avec notamment une exposition de cerfs-volants traditionnels baramon.
・Des expositions temporaires sont régulièrement organisées pour présenter l’histoire et les produits des îles Goto.