・Ce musée a ouvert en 1966 en tant que musée chrétien Amakusa de Hondo. C’est le plus ancien musée d’Amakusa.
・Il a été rénové en 2010 et comprend maintenant quatre zones : la zone « Histoire des chrétiens à Amakusa », la zone « Introduction de la culture nanban et Amakusa », la zone « Rébellion de Shimabara-Amakusa » et la zone « Reconstruction d’Amakusa et foi chrétienne après la rébellion ».
・Le musée expose régulièrement la bannière chrétienne d’Amakusa Shiro. Cette bannière, qui a été désignée bien culturel important du Japon, a été utilisée pendant la rébellion de Shimabara-Amakusa et est devenue un des symboles de l’histoire des chrétiens au Japon.