1881年に長崎に上陸したマタラ神父は、以後、黒島・平戸地区で40年にわたって宣教活動を行う。解禁直後は、各地の教会に常任司祭がいなかったため、紐差（ひもさし）を中心に、黒島、田平、生月島（いきつきじま）、馬渡島（まわたりじま）など広範囲に巡回していたが、当時は海陸共に交通手段がなかったため、御用船またはカコー船と呼ばれる小さな専用の船が使われていた。この船は、全長9mあまりの帆船で、追い風の時は帆で走り、風がない日は櫓漕ぎ（ろこぎ）で走っていた。このような、神父を乗せた船が港を巡回する風景は、県北地区に限らず長崎県内の各地で見られ、晴れてキリスト教の信仰が許された象徴的な風景の一つであった。

御用船を走らせる水夫は経験者が当番制で担当していたが、各自が手飯・手煙草の無報酬で布教活動を手伝っていたと伝えられている。大正時代の中期頃から、各教会に司祭が赴任したので巡回の必要がなくなり、御用船も見られなくなった。紐差教会史料保存室には、当時の御用船の模型が展示されている。